¿Se pueden recuperar datos del Contaplus 2006 con el Contaplus 2007 o Contaplus 2008?

No puedes hacerlo, ya que la actualización de versiones debe hacerse sobre la versión anterior.

Además, debes preguntar a SAGE si se puede pasar directamente de la 2003 a la 2008, sin usar una versión intermedia.

La copia de seguridad de una no te vale para la otra.

Una solución un poco bestia es que exportes los asientos y las subcuentas en XBase, desde el menu de Exportar, y que luego los importes desde el Contaplus 2008.

Todo ello deberás hacerlo sin haber cambiado al Nuevo Plan General Contable del 2007.

Un saludo
Miguel